Mar. 9th, 2017

[identity profile] thundersnatch.livejournal.com
Автор: Dr. Ling-Hong Hung
Университет Вашингтона
8 марта 2017 г.

Кратко
Данные проекта «Питательный рис для мира» теперь доступны на веб-сервере, созданном исследователями, и недавно они опубликовали небольшую заметку об их результатах.


Результаты проекта «Питательный рис для мира» были недавно опубликованы в открытом доступе, что делает их доступными для общественности и для всех исследователей, которые захотят использовать эту информацию для своей работы.

Цель проекта состояла в том, чтобы предсказать структуру белков основных сортов риса, которые могли бы однажды помочь фермерам лучше размножать рисовые штаммы. Определение структуры белков является чрезвычайно сложным и дорогостоящим процессом, а в рисе содержатся тысячи различных белков. Поэтому мы обратились к World Community Grid, за помощью в этой сложной задаче.

Мы описали нашу работу в небольшом документе, который был опубликован на сервере предварительной печати BiorXiv лаборатории Cold Spring Harbor. Исследователи теперь могут читать о том, как были созданы рисовые структуры проекта «Питательный рис для мира» и выбраны лучшие модели. В документе также описывается веб-сервер, который позволяет ученым найти интересующий конкретный белок и загрузить структуры. Форматы и процедура запроса подробно описаны для облегчения использования сервера и белковых структур. Весь набор данных можно также загрузить по запросу.

В зависимости от использования и реакции мы можем представить документ для публикации в более официальном журнале. Тем не менее, публикация этого документа официально завершает проект. Мы благодарим членов World Community Grid за то, что они пожертвовали свое время проекту «Питательный рис для мира». Для меня большая честь участвовать в этом проекте и иметь поддержку со стороны многих добровольцев.

новость на англ.
[identity profile] thundersnatch.livejournal.com
Большая вычислительная сеть, которая помогала разрабатывать кандидатов на раковые препараты и искать внеземную жизнь, пытается сохранить свою сеть добровольцев.

22 февраля 2017 года, Айви Ши

Инициатива граждан в области науки, поощряющая публичные пожертвования от неиспользуемой вычислительной мощности компьютера для проведения сложных вычислений, изо всех сил пытается расширить активную работу.

В течение 15 лет для поддержки исследовательских проектов в медицине, математике, изменении климата, лингвистике и астрофизике работает Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC), большая сеть, которая использует мощности добровольцев для научных вычислений.

Но, несмотря на высокий спрос ученых на суперкомпьютеры или компьютерные сети, которые могут быстро анализировать большие объемы данных, BOINC, существующий благодаря волонтерам, пытается поддерживать и развивать свою сеть пользователей, жертвующих свою резервную вычислительную мощь. Из 4 миллионов зарегистрированных пользователей активными являются только 6% и их количество снижается с 2014 года.

«Я постоянно ищу способы обратить в BOINC основную массу населения и это сложная задача», - говорит Дэвид Андерсон, соучредитель и ученый из Калифорнийского университета в Беркли.

Андерсон говорит, что BOINC, который финансируется Национальным научным фондом, в настоящее время хостит 56 научных проектов, охватывающих международную сеть, состоящую из более чем 760 000 компьютеров. Комбинированная вычислительная мощность платформы походит на суперкомпьютер, чья производительность входит в десятку лучших в мире.

Доступ к таким суперкомпьютерам может быть дорогостоящим и требует длительного ожидания, поэтому BOINC предлагает исследовательским группам доступ к вычислительной мощности, снижая непомерно высокие затраты.

«В типичном проекте BOINC используется петафлоп вычислений, который обычно стоит 100 тыс. долларов США в год. Если бы вам пришлось покупать столько же вычислительной мощности на облаке Amazon, это стоило бы около 40 миллионов долларов », - говорит Андерсон.

Кевин Винсен, ученый из Международного центра радиоастрономических исследований, Австралия, возглавляет проект, который анализирует фотографии галактик. BOINC помогает анализировать огромный набор данных SkyNet, что особенно ценно с учетом ограниченного бюджета проекта.

«В BOINC у меня может одновременно работать 20 000 человек. Каждый из них делает небольшую часть галактики", - говорит он.

Андерсон хочет подключить BOINC к крупнейшим суперкомпьютерным центрам в Соединенных Штатах, чтобы сократить длительные ожидания исследователей, которые должны обрабатывать свои данные. Он работает над тем, чтобы добавить сеть в Texas Advanced Computing Center в качестве дополнительного ресурса для исследователей.

пытаясь привлечь толпу

Несмотря на ряд инициатив по расширению участия, BOINC изо всех сил старается увеличить количество пользователей, передающих компьютерную мощь. Он сотрудничал с тайваньской компанией мобильной связи, компанией HTC, которая предустанавливала приложение BOINC на телефонах Android, чтобы поощрять пользователей жертвовать свои мощности обработки простоя в сети. Но приложение на самом деле не взлетело.

Андерсон также ведет переговоры с производителями видеоигр, чтобы включить BOINC в игровые консоли, чтобы игроки, которые решили внести свой вклад в BOINC, могли быть вознаграждены игровыми кредитами.

Некоторые исследователи проявляют креативность. Винсен вознаграждает участников своего проекта, отправив наборы Lego. Он изучает 3D-печать, чтобы сделать кастомные игрушки еще одним стимулом.

на англ.

Profile

Volunteer Computing ( добровольные вычисления )

July 2017

S M T W T F S
      1
2345678
9 101112131415
16171819202122
23242526272829
3031     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jul. 20th, 2017 02:33 pm
Powered by Dreamwidth Studios