У FightAIDS@Home новый инструмент и новый член команды

[paroh]

Автор: Доктор Артур Олсон
Профессор, Научно-исследовательский институт Скриппса
9 февраля 2018 г.

Кратко:
Проект FightAIDS@Home ищет возможные соединения для нацеливания на белковую оболочку внутри ВИЧ (называемую ядром капсида), которая защищает вирусную РНК. В настоящее время нет одобренных препаратов, нацеленных на эту белковую оболочку. В этой новости доктор Олсон резюмирует прогресс команды на сегодняшний день, описывает новый программный инструмент, который поможет их работе, и представляет нас новому члену исследовательской группы.

Структура белка капсида (CA) ВИЧ-1 показана выше. Команда FightAIDS@Home ищет активные соединения, которые могут присоединяться к белкам СА и опосредовать монтаж ядра капсида.

Изучение капсида ВИЧ

В наших последних исследованиях, посвященных открытию лекарств от ВИЧ, изучается ВИЧ-капсид, новая белковая цель для разработки противовирусных препаратов для ВИЧ, которые могут снизить вероятность резистентности к лекарственным средствам у инфицированных лиц, находящихся на лечении. Д-р Пэррик Кравеур запускал массивные виртуальные экраны против четырех перспективных участков на этом важном вирусном белке, который необходим для заражения. Он завершил более 600 миллионов стыковок, используя библиотеку из более чем 1,5 миллионов доступных химических соединений против более чем 30 вариантов этих четырех целевых участков.

В настоящее время большая часть результатов добровольцев FAAH была получена, и сейчас мы находимся в процессе экспериментальной оценки 30 наиболее перспективных соединений против первых двух участкова капсида. Таким образом, мы завершили работу над этой вычислительной частью FightAIDS@Home.

Новый фильтр

В дополнение к его виртуальным усилиям скрининга, д-р Craveur разработал веб-инструмент, который позволяет нам легко фильтровать эти миллионы результатов стыковки, чтобы найти соединения, обладающие специфическими химическими и энергетическими связующими характеристиками, которые могут сделать их перспективными в качестве новых лекарственных кандидатов. Этот инструмент использовался для идентификации этих исходных 30 соединений, которые будут заказываться и тестироваться в биологических анализах.

Доктор Кравеур закончил свое постдокторское обучение здесь, в Скриппсе, и он вернулся в свою родную Францию ​​для работы в биотехнологической промышленности. Он будет продолжать сотрудничать с группой Олсона в написании новаторских исследований, которые он провел здесь.

Новый член исследовательской группы

Тем временем мы приняли нового докторанта в нашу лабораторию: д-р Джулия Бианко из Сардинии, Италия. Она присоединится к нашей группе в начале марта, чтобы продолжить нашу программу открытия лекарств от ВИЧ. Сначала она оценит виртуальные экраны, которые завершил доктор Кравеур, чтобы найти новых перспективных кандидатов из двух других участков, которые были исследованы FightAIDS@Home. Она также продолжит проект FightAIDS@Home первой фазы, который, скорее всего, будет нацелен на интегразу, еще одну многообещающую цель ВИЧ. Исследования нашего Центра по ВИЧ-инфекции показали, что эта цель имеет неожиданную новую и важную функцию в жизненном цикле вируса.

Мы ожидаем перерыва около четырех месяцев, в то время как д-р Bianco оценивает существующие результаты FAAH, поднимаясь к рестарту первой фазы нашей виртуальной работы по скринингу.

Спасибо всем, кто поддержал FightAIDS@Home. Когда мы начнем следующий этап проекта, мы свяжемся с вами.

новость на англ.