ru_crunching | Августовские новости: OpenPandemics

31 августа 2021 г.

Предистория

OpenPandemics - COVID-19 был создан, чтобы ускорить поиск потенциальных методов лечения COVID-19. Проект также направлен на создание набора инструментов с открытым исходным кодом для быстрого реагирования, который может помочь всем ученым быстро искать методы лечения в случае будущих пандемий.

В конце 2020 года исследователи объявили, что отобрали 70 соединений (из первоначальной группы примерно 20000), которые могут быть многообещающими для исследования в качестве потенциальных ингибиторов вируса, вызывающего COVID-19. Лабораторные испытания 25 из этих соединений продолжаются.

Ускорена работа World Community Grid на четырех участках привязки

Исследовательская группа недавно отправила 600 пакетов ускоренной работы в World Community Grid. Эти партии содержат смоделированные эксперименты по нескольким важным участкам связывания и дополнительным соединениям, которые могут быть многообещающими в качестве потенциальных методов лечения.

Сульфонилфторид (SuFEx) - это молекула, которая, как известно, реагирует и ковалентно связывается с боковыми цепями аминокислот лизина (K) и тирозина (Y) в белках.

Исследователи выбрали четыре возможных участка связывания в основной протеазе (Mpro) SARS-CoV-2, которые примыкают к боковым цепям K и Y. Затем они подготовили около 600 упаковок для стыковки с почти 300 000 молекул Enamine, содержащих SuFEx. Эти партии были недавно завершены в World Community Grid.

Наиболее многообещающие молекулы будут закуплены или синтезированы, а затем отправлены в лабораторию профессора Криса Шофилда в Лабораторию химических исследований Оксфордского университета для экспериментальной проверки, связываются ли они с SARS-CoV-2 Mpro.

Текущее состояние рабочих единиц

CPU