ru_crunching | Entries tagged with scc

24 августа 2020

Кратко
Исследователи Smash Childhood Cancer предоставили технической команде World Community Grid новые рабочие единицы для тестирования и исследователи также продолжают анализ результатов моделирования, которые они уже получили.

Предистория проекта

За последние 20 лет только небольшое количество новых лекарств, предназначенных для лечения рака у детей, было одобрено Управлением по контролю за продуктами и лекарствами США. Половина всех химиотерапевтических методов лечения детей, больных раком, существует уже 25 или более лет.

Исследовательская группа Smash Childhood Cancer определила белки и другие молекулы, которые играют ключевую роль в определенных детских раковых заболеваниях. Теперь задача состоит в том, чтобы найти химические препараты-кандидаты, которые специально нацелены на эти ключевые молекулы и, следовательно, контролируют раковые клетки.

Тестирование новых рабочих единиц

Техническая группа World Community Grid в настоящее время проводит альфа-тестирование (или внутреннее тестирование небольшой выборки) для новых рабочих единиц, которые будут касаться белка, который исследователи хотят изучить.

Мы опубликуем сообщение на форуме World Community Grid, как только этот процесс будет завершен и мы будем готовы начать бета-тестирование.

Анализ данных

Пока техническая команда работает над альфа-тестированием, исследователи заняты анализом данных из предыдущих пакетов работы, которые были обработаны в World Community Grid.

Ниже приведен список ключевых белков, которые были исследованы на данный момент, а также краткое описание их текущего статуса. Каждый из этих белков участвует в развитии по крайней мере одного типа рака у детей, а некоторые также могут иметь значение у рака взрослых.

Бета катенин
Завершена работа над World Community Grid, исследователи проводят тестирование 12 соединений, которые показали потенциал для воздействия на этот белок.

LIN28B
Продолжаем анализ структуры белка и ищем дополнительное финансирование для дальнейшего изучения

Остеопонтин
Продолжаем анализ структуры белка

PAX3:FOX01
Начинаем анализировать результаты данных World Community Grid и ищем дополнительное финансирование для дальнейшего изучения

PRDM14
Поданы документы на грант для финансирования дальнейшего анализа

Каждый шаг в процессе анализа данных может занять много месяцев. Мы будем уведомлять всех в будущих ежемесячных обновлениях, когда будет заметен прогресс в анализе каждого белка, указанного выше.

Поиск дополнительных членов исследовательской группы

Исследовательская группа в настоящее время ищет дополнительного члена команды или сотрудника, который поможет восстановить входные данные, необходимые для создания исследовательских задач (или рабочих единиц) для World Community Grid.

Текущее состояние рабочих единиц

Приостановлено до завершения альфа-тестирования (см. Раздел «Тестирование новых рабочих единиц» выше).

Щелкните здесь, чтобы узнать больше о ежемесячных обновлениях проекта World Community Grid.

на англ.

paroh

та
Автор: Исследовательская команда Smash Childhood Cancer
9 марта 2020 г.

Кратко
Исследователи Smash Childhood Cancer рады сообщить, что доктор Годфри Чан, один из основателей команды, станет новым главным исследователем проекта. Проект перезапускается с двумя новыми целями для исследования в продолжающемся поиске лучшего лечения рака у детей.

Спасибо доктору Акире Накагаваре

Доктор Акира Накагавара

Команда Smash Childhood Cancer и World Community Grid выражают благодарность доктору Акире Накагаваре за его многолетнее руководство и службу в качестве главного исследователя исследовательских групп «Помощь в борьбе с раком детства» и «Сокрушим детский рак». Он уходит с поста главного следователя, чтобы проводить больше времени со своей семьей, но останется частью исследовательской группы и будет участвовать в будущей работе.

Под руководством доктора Накагавары в рамках проекта «Помощь в борьбе с раком у детей» были обнаружены семь лекарственных кандидатов, которые очень перспективны в качестве новых методов лечения нейробластомы, одной из наиболее распространенных и опасных форм рака у детей. Чтобы помочь развить эти открытия, он расширил первоначальный проект до международного сотрудничества в рамках проекта «Сокрушим десткий рак», который занимается поиском потенциальных методов лечения опухолей головного мозга, опухолей Вильмса (злокачественные новообразования в почках), гепатобластомы (рак печени), герминогенных опухолей и остеосаркомы (рак кости).

Добро пожаловать доктору Годфри Чану

Доктор Годфри Чан

Доктор Годфри Чан, один из первых членов команды Smash Childhood Cancer станет новым главным исследователем проекта. Будучи детским онкологом и исследователем, специализирующимся на трансляционных медицинских исследованиях и клинических испытаниях, он специализируется на скрининге и разработке новых лекарств, предназначенных для известных или сконструированных определенных молекул.

Он является руководителем и начальником службы Департамента педиатрии и подростковой медицины в Университете Гонконга. Он также является директором Молекулярной лаборатории традиционной китайской медицины (скрининг новых лекарств для иммунологии и рака) и был заместителем директора Консорциума по стволовым клеткам и регенеративной медицине (клиническое применение мезенхимальных стволовых клеток) в Университете Гонконга.

Д-р Чен является председателем Continental (Африка, Азия и Австралия) в исследовательском и исполнительном комитете Advance Neuroblastoma, членом группы SIOPEN (европейская нейробластома). Он получил несколько международных наград (ANR, SIOP, ASPR, исполнительная награда Endeavour - правительство Австралии, выдающийся педиатр APPA) за свои клинические и лабораторные исследования по детским нейрогенным опухолям и биологии стволовых клеток.

Спасибо обоим выдающимся исследователям за их постоянную работу по борьбе с раком у детей.

Новые цели

Новейшие рабочие юниты Smash Childhood Cancer будут рассматривать две потенциально важные цели, PRDM14 и Fox01.

PRDM14 участвует во внутричерепных эмбрионально-клеточных опухолях клеток (IGCTs), которые в основном поражают подростков и молодых людей. Это очень редкие опухоли головного мозга, которые встречаются гораздо чаще в Японии и Восточной Азии. В дополнение к IGCT, PRDM14 также влияет на немелкоклеточный рак легких, рак молочной железы, лейкемию (как пре-В-клеток, так и Т-клеток), а также рак простаты.

Считается, что Fox01 играет роль в развитии ряда видов рака в дополнение к раку у детей, включая рак предстательной железы, эндометриальный, панкреатический и другие.

После того, как работа World Community Grid над этими двумя целями будет завершена, мы ожидаем, что у волонтеров будет еще несколько возможностей. Спасибо всем за поддержку проекта Smash Childhood Cancer.

на англ.

paroh

5 декабря 2018 г.

Кратко
Команда Smash Childhood Cancer ( сокрушить детский рак ) недавно приветствовала нового исследователя из США. Некоторые из исследователей впервые встретились лично для обсуждения проекта.

Добро пожаловать к д-ру Чарльзу Келлеру

Доктор Чарльз Келлер

Мы сильно взволнованы тем, что Чарльз Келлер, MD, присоединился к исследовательской группе Smash Childhood Cancer. Доктор Келлер является научным руководителем Института развития детской онкологической терапии в штате Орегон.

Исследование доктора Келлера фокусируется на разработке более эффективных, менее токсичных методов лечения детского рака. Его особый интерес представляет собой прогрессирующее заболевание, распространяющееся за пределы исходного положения рака или делающее опухоль хирургически неудаляемой. Узнайте больше о его квалификации на странице «Участники исследования».

Международное общество детской онкологической конференции

Слева направо: д-р Акира Накагавара, Ай Огава (IBM), д-р Чинг Лау, д-р Тюджи Хошино

Исследователь Smash Childhood Cancer Др. Годфри Чан (справа) остановился на стенде IBM, чтобы обсудить проект с участниками конференции.

Несколько исследователей проекта впервые встретились на 50-м Конгрессе Международного общества детской онкологии (SIOP) в середине ноября. Эта крупная глобальная конференция, которая проводилась в этом году в Киото, в Японии, объединяет исследователей для улучшения перспектив онкологических больных детей. Доктор Акира Накагавара, главный исследователь проекта Smash Childhood Cancer, был председателем местного организационного комитета конференции.

Всемирная сеть сообщества и проект Smash Childhood Cancer были представлены на конференции Ай Огава, менеджером по вопросам гражданства IBM для Японии. Во время конференции она присутствовала на встрече с докторами Накагавара, Чан, Лау и Хосино, где исследователи обсудили, как уточнить свои методы поиска эффективных лекарств для конкретных целей в раковых клетках.

Команда планирует снова встретиться в ближайшее время - на этот раз в Гонконге - для более углубленного обсуждения их роли в проекте.

Мы ценим поддержку каждого для Smash Childhood Cancer!

paroh

Автор: Dr. Akira Nakagawara, MD, PhD
Генеральный директор Медицинского центра Saga KOSEIKAN и почетный президент Центра рака Chiba
5 июня 2018 г.

Кратко
Исследовательская группа Smash Childhood Cancer недавно выбрала несколько новых молекул-мишеней в качестве фокуса своей текущей работы. Узнайте больше о значимости этих молекул в этой новости.

Watch on YouTube

Прошло почти полтора года с тех пор, как мы начали проект Smash Childhood Cancer. От имени всех членов команды я действительно ценю вклад добровольцев в этот проект.

Добавив новых членов в оригинальную группу из проекта «Помощь в борьбе с детским раком», наша исследовательская группа Smash Childhood Cancer стала довольно интернациональной, в этом крупном новом проекте по разработке лекарств участвовали педиатры из Японии, Гонконга и США.

В то время как цель проекта «Борьба с детскими раковыми заболеваниями» заключалась в поиске новых и лучших методов лечения нейробластомы, Smash Childhood Cancer затрагивает не только нейробластому, но и другие детские раковые заболевания, такие как опухоли головного мозга, остеосаркому (рак кости), опухоли зародышевых клеток, гепатобластому (рак печени ) и другие.

Несколько белков - бета-катенин, LIN28B, N-CYM и другие - были вновь выбраны в качестве молекул-мишеней. Определены структуры белков бета-катенина и LIN28B, поэтому в скрининге in silico для них было начато изучение соединений с высоким связыванием из библиотеки более чем 3-х миллионов небольших молекул.

N-CYM-белок, который был обнаружен моей командой и мной, является новым продуктом гена-стимулятора нейробластомы. Белок встречается только у людей и шимпанзе и создается посредством эволюции de novo (что означает, что это часть эволюции рака). По какой-то причине белок довольно сложно кристаллизовать, и мы все еще работаем над определением его точной структуры, чтобы начать открытие лекарств против него.

Недавно мы получили грант от японского правительства для поддержки нашего открытия лекарств против белка LIN28B, что может помочь ускорить наш прогресс в борьбе с детским раком.

Еще раз хочу выразить благодарность добровольцам во всем мире, которые поддерживают проект. Для детей, которые борются с раком, мы хотели бы как можно скорее открыть новый препарат и разработать лечение без последующих побочных эффектов.

на англ.

thundersnatch.livejournal.com

Автор: Исследовательская группа Smash Childhood Cancer
29 января 2017

Кратко:
Проект Help Fight Childhood Cancer сделал крупное открытие, когда они обнаружили несколько потенциальных кандидатов препарата для борьбы с нейробластомы. Сегодня мы вновь с гордостью сообщаем, что ведущий ученый проекта собрал международную команду, чтобы бороться с еще большим числом раковых заболеваний у детей.

Базовая проблематика

Ежегодно около 300 000 у детей обнаруживают рак и около 80-ти тысяч умирают от рака. В 2009 году World Community Grid вступил в бой, чтобы улучшить эти мрачные статистические данные, поддержав Help Fight Childhood Cancer (помогите бороться с детским раком). С помощью более 200000 добровольцев, которые пожертвовали вычислительное время своих устройств, проект помог ученым обнаружить несколько потенциальных кандидатов лекарства, которые могут привести к лечению нейробластомы, одного из наиболее распространенных видов рака у младенцев и детей младшего возраста.

Теперь, доктор Акира Накагавара, ведущий ученый из Help Fight Childhood Cancer, создал международную команду исследователей, чтобы искать лекарственные кандидаты для дополнительных видов раковых заболеваний у детей с помощью проекта Smash Childhood Cancer. И еще раз команда просит добровольцев со всего мира пожертвовать их неиспользованное время вычислений для исследования.

Жизнь, посвященная борьбе с раком

Решение доктора Накагавара бороться с раком возникло, когда он был еще ребенком. Его нежно любимому отцу, который был дантистом, был поставлен диагноз рака в то время как доктор Накагавара был в начальной школе. Он говорит: «Став свидетелем болезни моего отца, и в конечном счете его смерти, я решил посвятить свою жизнь борьбе с раком."

В медицинской школе, доктор Накагавара выбрал специализацию раковых заболеваний у детей. "Я чувствовал, что если бы я мог продвинуть исследования в области искоренения раковых заболеваний у детей, результаты также смогут быть применены к раковых заболеваниям у взрослых", объясняет он. В процессе своей карьеры он стал всемирно известным и уважаемым детским онкологом. Он путешествует по всему миру, чтобы работать с коллегами из многих стран, а также принимает активное участие в исследованиях и разработке новых методов лечения рака. В частности, он является авторитетом по нейробластоме, детскому раку, который формируется в определенных типах нервной ткани.

Борьба с детским раком с помощью добровольных вычислений

Работая с другими исследователями, д-р Накагавара определил несколько ключевых белков, которые связаны с нейробластомой. Но как только были идентифицированы эти ключевые белки, он знал, что нужно искать через библиотеку миллионов потенциальных медикаментов, чтобы найти любые, которые потенциально могут отключить эти белки и разрушить клетки нейробластомы.

Так, в 2009 году он обратился к добровольцам World Community Grid, которые жертвуют свое неиспользованное время вычислений для гуманистической науки и проект Help Childhood Cancer был создан. "Мы были взволнованы идеей такой массивной вычислительной мощности для нашего исследования," говорит д-р Nakagawara. "Нам также понравился аспект сообщества - то, что World Community Grid для всех, и каждый, кто с компьютером и доступом в Интернет, может участвовать."

Более 200000 человек со всего мира поддержали проект, загрузив программное обеспечение World Community Grid, которое позволяет части мощности своих компьютеров использоваться для выполнения виртуальных экспериментов от имени д-ра Накагавары. А в 2014 году исследователи объявили о крупном открытии семи потенциальных кандидатов лекарств, которые уничтожили клетки нейробластомы у мышей, а самое главное, сделали это, не вызывая каких-либо видимых побочных эффектов.

Расширение поиска

В то время пока он продолжает исследования перспективных лекарственных кандидатов, найденных в его первом проекте World Community Grid, д-р Накагавара и большая международная команда исследователей начинают новое исследование. Помимо дальнейшего исследования потенциальных методов лечения нейробластомы, новый проект Smash Childhood Cancer будет также искать новые методы лечения для:

опухолей головного мозга
опухоли Вильмса - злокачественной опухоли почки
гепатобластомы - рака печени
эмбрионально-клеточной опухоли - незрелых клеток, которые могут появиться в репродуктивной и центральной нервной системе у детей
остеосаркомы - рака кости

В будущем, Smash Childhood Cancer может расшириться, чтобы включить дополнительные виды детского рака.

Используя те же исследовательские инструменты и методы, которые привели к перспективным выводам в ходе проекта Help Childhood Cancer, подход Smash Childhood Cancer является поиском лигандов (химические соединения или молекулы), которые связываются с конкретными целевыми белками, участвующими в детских раковых заболеваниях, перечисленных выше. Под руководством доктора Накагавара расширенная исследовательская группа включает в себя следующие институты и ученых:

Медицинский центр Сага KOSEIKAN - Хидеки Izumi, PhD; Yuanyuan Ли,PhD; Ацуши Нагатомо
Chiba университет - Tyuji Хосино, PhD
Университет Гонконга - Годфри Чи-Фун Чан, доктор медицинских наук, МДД, MSc
Коннектикутский детский медицинский центр,Лаборатория геномной медицины Джексона и Школа медицины университета штата Коннектикут - Ching C. Lau, MD, PhD, FAAP
Университет Киото - Ясухиро Ямада, PhD

Ваша помощь имеет решающее значение

Сами по себе доктор Накагавара и его исследовательская группа имели бы огромные трудности скрининга миллионов химических соединений. К счастью, именно там World Community Grid может помочь - позволяя исследователям использовать методы виртуального скрининга для оценки этих соединений против специфических белков, связанных с раковыми заболеваниями у детей. Этот процесс виртуального скрининга позволяет исследователям прогнозировать эффективность многих препаратов в качестве потенциальных методов лечения рака.

Доктор Накагавара и его команда взволнованы и оптимистичны, начав новый проект, который имеет большой потенциал для многих детей и семей, страдающих каждый год от рака. Он говорит: "Мы надеемся, что все будут подписываться, внося свой вклад в этот проект, и также, расскажут своим друзьям. Чем больше волонтеров жертвует нам неиспользованное время вычислений, тем быстрее мы сможем громить детский рак... вместе ".

новость на англ.