![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
paroh posting in ![[community profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/community.png){kind=small}
ru_crunchingМы продолжаем работу по характеристике биомаркеров рака легких, выявленных в рамках проекта MCM1. Эта новость посвящена транскрипционному корепрессору TLE3.
Проект: Картирование маркеров рака
Опубликовано: 16 февраля 2024 г.
Терминология
- Фактор транскрипции: белок, который связывается с ДНК и контролирует скорость транскрипции ДНК в информационную РНК.
- Транскрипционный корепрессор: белок, который косвенно подавляет экспрессию генов путем связывания с факторами транскрипции.
- Синдром Шихана: послеродовая недостаточность гормонов передней доли гипофиза из-за некроза гипофиза. Обычно это является результатом массивного кровотечения во время или после родов.
Предистория
Идентификация молекулярных маркеров и их комбинаций (сигнатур) позволяет нам выявлять заболевание на более ранних стадиях (диагностические сигнатуры) и стратифицировать пациентов на подгруппы на основе закономерностей прогрессирования заболевания (прогностические сигнатуры), что потенциально приводит к определению того, какие пациенты могут получить пользу от какого лечения (прогнозирующие сигнатуры). Проект Mapping Cancer Markers анализирует наборы данных с миллионами точек данных, собранных у пациентов с раком и саркомой, чтобы найти такие диагностические, прогностические и прогнозирующие признаки.
С ноября 2013 года волонтеры World Community Grid пожертвовали проекту более 887 100 лет процессорного времени, помогая анализировать данные о раке и саркоме легких и яичников, гораздо более тщательно, чем это было бы возможно в противном случае. Мы безмерно благодарны за эту постоянную поддержку.
Далее характеризуя 26 генов с наибольшим количеством баллов при раке легких, мы уже обсуждали VAMP1, FARP1, GSDMB, ADH6, IL13RA1 и PCSK5 в предыдущих новостях MCM. Здесь мы изложим информацию о TLE3.
Исследование TLE3.
TLE3 кодирует белок, называемый трансдуцин-подобным энхансерным белком 3, который является корепрессором транскрипции, связывающимся с несколькими факторами транскрипции (Uniprot). TLE3 участвует в иммунных функциях. Исследования показали, что TLE3 способствует развитию B-клеток памяти[1] и участвует в поддержании иммунного гомеостаза кишечника[2]. Одно исследование также показало, что экспрессия TLE3 была значительно увеличена у пациентов с синдромом Шихана по сравнению с контрольной группой [3].
Было обнаружено, что TLE3 играет защитную роль при раке легких, что соответствует генам, которые мы представили ранее (рис. 1).
Рисунок 1. Кривые выживаемости пациентов с высокой и низкой экспрессией TLE3 (KMplot).
Эта общая тенденция выживания еще сильнее проявляется у женщин, как показано на рисунке 2.
Рисунок 2. Кривые выживаемости женщин с раком легких с высокой и низкой экспрессией TLE3 (KMplot).
Мы продолжили исследование, чтобы выяснить, связана ли экспрессия TLE3 с другими видами рака. Как показано на рисунке 3, при сравнении рака с нормальной тканью, TLE3 дифференциально экспрессируется в большинстве видов рака (выделено красным шрифтом). В литературе экспрессия TLE3 связана с меланомой[4], рабдомиосаркомой[5], реакцией рака яичников на лечение[6], прогнозом рака молочной железы[7] и реакцией на лечение[8].
Рисунок 3. Экспрессия TLE3 в нормальной и раковой ткани при нескольких типах рака. Красный текст представляет значительную разницу между экспрессией в раковой ткани по сравнению с нормальной тканью (TNMplot).
Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы ответили!
Команда WCG
на англ.
Проект: Картирование маркеров рака
Опубликовано: 16 февраля 2024 г.
Терминология
- Фактор транскрипции: белок, который связывается с ДНК и контролирует скорость транскрипции ДНК в информационную РНК.
- Транскрипционный корепрессор: белок, который косвенно подавляет экспрессию генов путем связывания с факторами транскрипции.
- Синдром Шихана: послеродовая недостаточность гормонов передней доли гипофиза из-за некроза гипофиза. Обычно это является результатом массивного кровотечения во время или после родов.
Предистория
Идентификация молекулярных маркеров и их комбинаций (сигнатур) позволяет нам выявлять заболевание на более ранних стадиях (диагностические сигнатуры) и стратифицировать пациентов на подгруппы на основе закономерностей прогрессирования заболевания (прогностические сигнатуры), что потенциально приводит к определению того, какие пациенты могут получить пользу от какого лечения (прогнозирующие сигнатуры). Проект Mapping Cancer Markers анализирует наборы данных с миллионами точек данных, собранных у пациентов с раком и саркомой, чтобы найти такие диагностические, прогностические и прогнозирующие признаки.
С ноября 2013 года волонтеры World Community Grid пожертвовали проекту более 887 100 лет процессорного времени, помогая анализировать данные о раке и саркоме легких и яичников, гораздо более тщательно, чем это было бы возможно в противном случае. Мы безмерно благодарны за эту постоянную поддержку.
Далее характеризуя 26 генов с наибольшим количеством баллов при раке легких, мы уже обсуждали VAMP1, FARP1, GSDMB, ADH6, IL13RA1 и PCSK5 в предыдущих новостях MCM. Здесь мы изложим информацию о TLE3.
Исследование TLE3.
TLE3 кодирует белок, называемый трансдуцин-подобным энхансерным белком 3, который является корепрессором транскрипции, связывающимся с несколькими факторами транскрипции (Uniprot). TLE3 участвует в иммунных функциях. Исследования показали, что TLE3 способствует развитию B-клеток памяти[1] и участвует в поддержании иммунного гомеостаза кишечника[2]. Одно исследование также показало, что экспрессия TLE3 была значительно увеличена у пациентов с синдромом Шихана по сравнению с контрольной группой [3].
Было обнаружено, что TLE3 играет защитную роль при раке легких, что соответствует генам, которые мы представили ранее (рис. 1).
Рисунок 1. Кривые выживаемости пациентов с высокой и низкой экспрессией TLE3 (KMplot).
Эта общая тенденция выживания еще сильнее проявляется у женщин, как показано на рисунке 2.
Рисунок 2. Кривые выживаемости женщин с раком легких с высокой и низкой экспрессией TLE3 (KMplot).
Мы продолжили исследование, чтобы выяснить, связана ли экспрессия TLE3 с другими видами рака. Как показано на рисунке 3, при сравнении рака с нормальной тканью, TLE3 дифференциально экспрессируется в большинстве видов рака (выделено красным шрифтом). В литературе экспрессия TLE3 связана с меланомой[4], рабдомиосаркомой[5], реакцией рака яичников на лечение[6], прогнозом рака молочной железы[7] и реакцией на лечение[8].
Рисунок 3. Экспрессия TLE3 в нормальной и раковой ткани при нескольких типах рака. Красный текст представляет значительную разницу между экспрессией в раковой ткани по сравнению с нормальной тканью (TNMplot).
Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы ответили!
Команда WCG
на англ.
