![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
paroh posting in ![[community profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/community.png){kind=small}
ru_crunchingМы продолжаем характеризовать биомаркеры рака легких, выявленные в проекте MCM1. Это обновление посвящено ASTN2, белку, участвующему в миграции нейронов. Он экспрессируется в нескольких типах тканей и участвует в различных видах рака.
Проект: Картирование маркеров рака
Опубликовано: 10 июля 2024 г.
Терминология
- Мальформация Киари I типа: порок развития, при котором часть головного мозга выпячивается через нормальное отверстие в черепе, где она соединяется с позвоночным каналом, оказывая давление на головной и спинной мозг.
- Хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ): группа заболеваний, вызывающих закупорку дыхательных путей и проблемы с дыханием.
- Глиобластома: тип рака, который формируется из клеток, называемых астроцитами, в головном или спинном мозге.
- Астроциты: тип клеток центральной нервной системы, которые играют важную роль в поддержке нейронов.
Предистория
Идентификация молекулярных маркеров и их комбинаций (сигнатур) позволяет выявлять заболевание на более ранних стадиях (диагностические сигнатуры) и стратифицировать пациентов на подгруппы на основе закономерностей прогрессирования заболевания (прогностические сигнатуры). Последняя группа маркеров помогает определить, каким пациентам будут полезны конкретные варианты лечения (прогностические признаки). Проект Mapping Cancer Markers анализирует наборы данных с миллионами точек данных, собранных у пациентов с раком, чтобы найти такие диагностические, прогностические и прогностические признаки.
С ноября 2013 года волонтеры World Community Grid пожертвовали на проект более 905 700 лет процессорного времени, помогая анализировать данные о раке и саркоме легких и яичников, гораздо более тщательно, чем это было бы возможно в противном случае. Мы безмерно благодарны за эту постоянную поддержку.
Сосредоточив внимание на характеристике 26 генов, наиболее результативных при раке легких,
мы уже обсуждали VAMP1, FARP1, GSDMB, AHD6, IL13RA1, PCSK5, TLE3, HSD17B11 и KLF5 в предыдущих новостях MCM. Здесь мы излагаем информацию о ASTN2.
Исследования АСТН2
ASTN2 (астротактин-2) представляет собой белок, который опосредует рециркуляцию ASTN1 (астротактин-1), который представляет собой молекулу адгезии нейрональных клеток. Этот процесс включает в себя содействие интернализации ASTN1 обратно в нейрон и обеспечение его транспортировки по всему нейрону во время миграции нейронов (Uniprot).
Учитывая роль ASTN2 в центральной нервной системе, понятно, что он участвует в эмоциональных и когнитивных функциях [1]. Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что ASTN2 играет роль в расстройствах, связанных с мозгом и когнитивными способностями, таких как болезнь Альцгеймера[2], психические расстройства[3], умственная отсталость[4], предрасположенность к мигрени[5] и мальформация Киари I типа[6]. Тем не менее, ASTN2 имеет низкую тканевую специфичность и экспрессируется во всех типах тканей, исследованных в Атласе белков человека. Соответственно, ASTN2 участвует в функции почек[7], эндометриозе[8], остеоартрите[9], кардиометаболических нарушениях[10,11] и хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ)[12]. Интересно, что эта связь с ХОБЛ характерна только для женщин[12]. Потенциальная роль ASTN2 при ХОБЛ заслуживает внимания, поскольку исследования показали, что ХОБЛ и рак легких тесно связаны на молекулярном уровне [13].
Рисунок 1. Экспрессия ASTN2 в различных типах тканей (Атлас белков человека).
Как и в случае с другими представленными нами генами, высокая экспрессия ASTN2 связана с более длительной выживаемостью при раке легких (рис. 2А). Примечательно, что эта связь присутствует только у женщин (рис. 2B), а не у мужчин (рис. 2C).
A
B
C
Рисунок 2. (A) Кривые выживаемости пациентов с раком легких с низкой и высокой экспрессией ASTN2 (KMplot), (B) только для женщин и (C) только для мужчин.
Хотя наше внимание сосредоточено на раке легких, мы дополнительно изучили, связан ли ASTN2 с другими типами рака. Как показано на рисунке 3, при сравнении раковых тканей с нормальными тканями, ASTN2 дифференциально экспрессируется в 13 из 22 проанализированных видов рака (обозначены красным текстом). Примечательно, что уровень ASTN2 повышается при 8 из этих видов рака, тогда как его уровень снижается только при 5. В литературе связь между ASTN2 и раком, по-видимому, недостаточно изучена, и по этой теме опубликовано очень мало статей. Однако одно исследование предположило, что ASTN2 связано с функцией легких [14], а другое исследование показало, что экспрессия ASTN2 повышена в клеточных линиях глиобластомы по сравнению с нормальными астроцитами человека [15].
Рисунок 3. Экспрессия ASTN2 в нормальной и раковой ткани при нескольких типах рака. Красный текст представляет собой значительную разницу между экспрессией в раковой ткани по сравнению с нормальной тканью (TNMplot).
Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы ответили!
Команда поддержки WCG.
на англ.
Проект: Картирование маркеров рака
Опубликовано: 10 июля 2024 г.
Терминология
- Мальформация Киари I типа: порок развития, при котором часть головного мозга выпячивается через нормальное отверстие в черепе, где она соединяется с позвоночным каналом, оказывая давление на головной и спинной мозг.
- Хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ): группа заболеваний, вызывающих закупорку дыхательных путей и проблемы с дыханием.
- Глиобластома: тип рака, который формируется из клеток, называемых астроцитами, в головном или спинном мозге.
- Астроциты: тип клеток центральной нервной системы, которые играют важную роль в поддержке нейронов.
Предистория
Идентификация молекулярных маркеров и их комбинаций (сигнатур) позволяет выявлять заболевание на более ранних стадиях (диагностические сигнатуры) и стратифицировать пациентов на подгруппы на основе закономерностей прогрессирования заболевания (прогностические сигнатуры). Последняя группа маркеров помогает определить, каким пациентам будут полезны конкретные варианты лечения (прогностические признаки). Проект Mapping Cancer Markers анализирует наборы данных с миллионами точек данных, собранных у пациентов с раком, чтобы найти такие диагностические, прогностические и прогностические признаки.
С ноября 2013 года волонтеры World Community Grid пожертвовали на проект более 905 700 лет процессорного времени, помогая анализировать данные о раке и саркоме легких и яичников, гораздо более тщательно, чем это было бы возможно в противном случае. Мы безмерно благодарны за эту постоянную поддержку.
Сосредоточив внимание на характеристике 26 генов, наиболее результативных при раке легких,
мы уже обсуждали VAMP1, FARP1, GSDMB, AHD6, IL13RA1, PCSK5, TLE3, HSD17B11 и KLF5 в предыдущих новостях MCM. Здесь мы излагаем информацию о ASTN2.
Исследования АСТН2
ASTN2 (астротактин-2) представляет собой белок, который опосредует рециркуляцию ASTN1 (астротактин-1), который представляет собой молекулу адгезии нейрональных клеток. Этот процесс включает в себя содействие интернализации ASTN1 обратно в нейрон и обеспечение его транспортировки по всему нейрону во время миграции нейронов (Uniprot).
Учитывая роль ASTN2 в центральной нервной системе, понятно, что он участвует в эмоциональных и когнитивных функциях [1]. Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что ASTN2 играет роль в расстройствах, связанных с мозгом и когнитивными способностями, таких как болезнь Альцгеймера[2], психические расстройства[3], умственная отсталость[4], предрасположенность к мигрени[5] и мальформация Киари I типа[6]. Тем не менее, ASTN2 имеет низкую тканевую специфичность и экспрессируется во всех типах тканей, исследованных в Атласе белков человека. Соответственно, ASTN2 участвует в функции почек[7], эндометриозе[8], остеоартрите[9], кардиометаболических нарушениях[10,11] и хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ)[12]. Интересно, что эта связь с ХОБЛ характерна только для женщин[12]. Потенциальная роль ASTN2 при ХОБЛ заслуживает внимания, поскольку исследования показали, что ХОБЛ и рак легких тесно связаны на молекулярном уровне [13].
Рисунок 1. Экспрессия ASTN2 в различных типах тканей (Атлас белков человека).
Как и в случае с другими представленными нами генами, высокая экспрессия ASTN2 связана с более длительной выживаемостью при раке легких (рис. 2А). Примечательно, что эта связь присутствует только у женщин (рис. 2B), а не у мужчин (рис. 2C).
A
B
C
Рисунок 2. (A) Кривые выживаемости пациентов с раком легких с низкой и высокой экспрессией ASTN2 (KMplot), (B) только для женщин и (C) только для мужчин.
Хотя наше внимание сосредоточено на раке легких, мы дополнительно изучили, связан ли ASTN2 с другими типами рака. Как показано на рисунке 3, при сравнении раковых тканей с нормальными тканями, ASTN2 дифференциально экспрессируется в 13 из 22 проанализированных видов рака (обозначены красным текстом). Примечательно, что уровень ASTN2 повышается при 8 из этих видов рака, тогда как его уровень снижается только при 5. В литературе связь между ASTN2 и раком, по-видимому, недостаточно изучена, и по этой теме опубликовано очень мало статей. Однако одно исследование предположило, что ASTN2 связано с функцией легких [14], а другое исследование показало, что экспрессия ASTN2 повышена в клеточных линиях глиобластомы по сравнению с нормальными астроцитами человека [15].
Рисунок 3. Экспрессия ASTN2 в нормальной и раковой ткани при нескольких типах рака. Красный текст представляет собой значительную разницу между экспрессией в раковой ткани по сравнению с нормальной тканью (TNMplot).
Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы ответили!
Команда поддержки WCG.
на англ.
